На устройствах Mikrotik с более, чем одни свичом (например модели 2011, 3011, 4011...) есть проблема с порт-флаппингом. Выглядит это как рандомные постоянные отключения и тут же обратные включения портов. Проблема давняя и компания в свое время выпустила фикс шредингера, который... ну вы поняли в общем. В подавляющем большинстве, флаппинг проявляется на портах второго свича.
Решений проблемы несколько:

1. Использовать только порты первого свича. Решение упоротое, но оно имеет место.
2. Отключение от микрота и всех подключенных к нему коммутаторов устройств с 100мбитным линком. Это поможет лишь в случае, если такие устройства в сети есть.
3. Наш любимый терминал (для тех, кто не в курсе, не весь функционал микротов доступен с «мышкокликательного» интерфейса).

Если с первыми двумя пунктами все понятно, то для выполнения третьего необходимо в терминал вбить команду:

/interface ethernet switch set switch1,switch2 cpu-flow-control=no

Если свичей на вашем устройстве больше двух, или они называются не стандартно, то соответственно дополнить\исправить в строке параметр «switch1,switch2».
Данное решение добавляет ограничения на использования функционала, относящегося к мониторингу интерфейсов, но, по крайней мере, убирает проблему с отвалом соединений.